Ikidomain voi olla myös DNSSEC suojattu jos oma nimipalvelimella olevat tiedot on suojattu DNSSEC:illä.

Mikäli käytetään esim bind:ia niin tämän saa tehtyä niin että laittaa nimipalvelun zone kohtaan auto-dnssec maintain; ja update-policy local; rivit eli esim:

zone "kivinen.iki.fi" {
        type master;
        file "kivinen.iki.fi.signed";
        auto-dnssec maintain;
        key-directory "/etc/namedb";
        update-policy local;
};

/etc/namedb hakemistoon pitää luoda avaimet dnssec-keygen ohjelmalla:

$ dnssec-keygen -a ECDSAP256SHA256 -n zone kivinen.iki.fi
$ dnssec-keygen -a ECDSAP256SHA256 -n zone -f KSK kivinen.iki.fi
<code>

Itse zone tiedostossa sitten sanotaan ''$INCLUDE K<avaintiedosto>.key'' sekä zone että KSK avaimille:

<code>
$ORIGIN .
$TTL 3600       ; 1 hour
kivinen.iki.fi          IN SOA  ns.kivinen.iki.fi. hostmaster.kivinen.iki.fi. (
                                2024053100 ; serial
                                3600       ; refresh (1 hour)
                                300        ; retry (5 minutes)
                                3600000    ; expire (5 weeks 6 days 16 hours)
                                3600       ; minimum (1 hour)
                                )
                        NS      ns.iki.fi.
                        NS      ns.kivinen.iki.fi.
                        NS      ns2.kivinen.iki.fi.
                        A       83.145.195.1
                        AAAA    2001:1bc8:100d::2
                        MX      1 mail.kivinen.iki.fi.

$INCLUDE Kkivinen.iki.fi.+013+61140.key
$INCLUDE Kkivinen.iki.fi.+013+61000.key

Tämän jälkeen allekirjoitetaan zone tiedosto komennolla:

dnssec-signzone -N INCREMENT -o kivinen.iki.fi kivinen.iki.fi

Tämä pitää tietysti tehdä joka kerta kun zone tiedostoa muutetaan.

Kun nimipalvelin on käynnstetty uudestaan niin sen jälkeen voi mennä iki:n jäsenrekisterin ja sanoa siellä että Hae DS tietueet ja tämä komento hakee tiedot jäsenen nimipalvelimesta ja muuttaa ne sopivaan muotoon ja lisää ne iki:n jäsenrekisteriin. Tämän jälkeen tunnin kuluttua voi ruveta testamaan että mitä nuo erilaiset dnssec testauspalvelut (esim https://dnsviz.net/) sanovat zonesta.